Entre juny i setembre 2022 l’app de GENIGMA es va quedar oberta amb noves dades del genoma de càncer de mama. L’objectiu era validar l’eina i testar a quina resolució s’aconsegueixen obtenir millors resultats per a la recerca.

El repte que llancem a l’estiu va ser el de resoldre 250 nous jocs de 15 i 12 peces a diferents resolucions. Si durant el #GenigmaChallenge cada peça que es movia en el puzle tenia la grandària de 100.000 parells de bases d’ADN, els nous jocs es van pujar a una resolució de 10K (és a dir que cada peça té la grandària de 10.000 parells de bases) o de 1Mb (cada peça té la grandària de 1.000.000 parells de bases).

Per a fer-vos una idea, és com si en lloc de mirar països, ara volguéssim mirar continents o ciutats.

En aquests 3 mesos més de 5400 persones (de les quals 2300 van ser nous jugadors) han col·laborat en aquest nou test jugant en les seves estones lliures. És increïble!

Les últimes solucions rebudes han aportat nova llum a la recerca. Encara que en el cas de la majoria dels jocs a resolució de 1Mb es van trobar resultats similars als que troba un algorisme bàsic, a les regions del cromosoma 9 jugades a la mateixa resolució jugadors i jugadores si van trobar noves regions Eureka! Això confirmaria que les persones són capaces d’identificar regions d’interès on els algorismes no poden, la qual cosa obre la possibilitat d’utilitzar GENIGMA en diferents resolucions en el futur per a aconseguir millors resultats.

En el cas dels jocs de les regions Eureka prèviament identificades durant el #GenigmaChallenge oferts en una resolució de 10Kb, les persones jugadores no van identificar reordenaments addicionals, la qual cosa indica que en aquestes regions analitzades no faria ulteriors canvis estructurals del genoma respecte als prèviament trobats.

Després d’aquests últims tests i de gairebé 700.000 dades recollits, concloem avui el primer #GenigmaChallenge dedicat al càncer de mama. Ara és el moment que els equips científics analitzin els resultats de GENIGMA en profunditat, abans de llançar un nou repte a la ciutadania. Des del CNAG i el CRG volem agrair a totes les persones que han col·laborat en aquest repte científic pel seu temps i el seu entusiasme.

El dia 3 d’octubre tancarem momentàniament l’app. Us mantindrem informats de totes les novetats en les nostres xarxes socials.

Fins aviat Genigmers!