El genoma humà està format per una seqüència de 3,000 milions de lletres. La seva seqüència i plegament a l’espai determinen el funcionament de les nostres cèl·lules. Sabem que a les cèl·lules canceroses tenen lloc intercanvis i reordenaments del material genètic (translocacions cromosòmiques) que modifiquen la seqüència “original”. Com a conseqüència, les zones de contacte entre diferents parts del genoma es modifiquen, el que pot provocar alteracions de les funcions essencials de les cèl·lules afectades.

Gairebé tots els càncers són provocats per anomalies en el material genètic de les cèl·lules. Però per cada càncer, aquestes anomalies són diferents.

Aquest projecte vol investigar les alteracions genòmiques en cèl·lules canceroses. S’analitzaran cèl·lules de càncer de 5 tipus diferents de cultius cel·lulars de laboratori: càncer de mama (T47D), càncer d’ovari (TOV21G), càncer ossi (U2OS), leucèmia (KBM7) i càncer cérvico-uterí (HeLa), fent servir cultius cel·lulars de laboratori.

Analitzar quines diferències hi ha entre cèl·lules sanes i canceroses significa analitzar pam a pam tot l’ADN d’aquestes cèl·lules i comparar-ho amb el de cèl·lules sanes.
No ho pot fer una màquina, això? Doncs si, però no afina. L’ull humà és molt millor identificant patrons i és per aquest motiu que l’equip científic ha decidit intentar desxifrar aquests patrons amb la col·laboració de la ciutadania.

Què farem? Dissenyar una aplicació per a telèfons mòbils, basada en dades reals obtingudes al laboratori, per fragmentar tot l’ADN d’aquests cèl·lules en petit trossos, que seran analitzats per voluntaris/es. L’objectiu és construir un mapa genòmic de referència que permeti entendre quines parts del genoma d’aquestes cèl·lules juga un paper fonamental en l’establiment i desenvolupament del càncer.